TAX ALERT: Zmiany w MDR staną się faktem

W piątek 19 czerwca 2026 r. Prezydent RP Karol Nawrocki podpisał nowelizację Ordynacji podatkowej. Zakłada ona istotne zmiany w zakresie raportowania schematów podatkowych – MDR. Nowe regulacje wejdą w życie 1 października 2026 r.

Najdalej idącą zmianą będzie likwidacja obowiązku raportowania krajowych schematów podatkowych. W praktyce oznacza to odejście od jednego z najbardziej rozbudowanych elementów polskiego systemu MDR, który wykraczał poza minimum wynikające z prawa unijnego. Po zmianach raportowanie będzie dotyczyć zasadniczo uzgodnień transgranicznych, czyli takich, których raportowanie wynika z dyrektywy Rady (UE) 2018/822, tzw. dyrektywy DAC6.

Nowelizacja doprecyzowuje również zakres podatków objętych MDR. Z obowiązku raportowania wyłączone zostaną uzgodnienia dotyczące podatku VAT oraz podatku akcyzowego. Jest to istotna zmiana praktyczna, ponieważ dotychczas polskie przepisy obejmowały także obszary, które nie musiały być raportowane na podstawie dyrektywy DAC6.

Co wprowadzi nowelizacja?

• likwidację obowiązku raportowania krajowych schematów podatkowych;
• wyłączenie z raportowania schematów dotyczących VAT i akcyzy;
• ograniczenie obowiązków MDR zasadniczo do schematów transgranicznych;
• zmianę w brzmieniu niektórych definicji, w tym m.in. kryterium głównej korzyści;
• usunięcie tzw. innych szczególnych cech rozpoznawczych;
• ograniczenie liczby oraz częstotliwości składania formularzy MDR;
• zniesienie obowiązku składania zawiadomień MDR-2;
• możliwość podpisywania informacji MDR-3 przez pełnomocnika;
• określenie jednego terminu składania MDR-3;
• zmiany w zakresie raportowania MDR-4;
• usunięcie osobnej kategorii wspomagającego i włączenie części czynności wspomagających do definicji promotora;
• wyłączenie możliwości uzyskania interpretacji indywidualnej w zakresie MDR.

Istotne znaczenie będzie miała również zmiana zasad raportowania w przypadku podmiotów objętych tajemnicą zawodową. Jeżeli przekazanie informacji o schemacie podatkowym przez promotora będącego m.in. doradcą podatkowym, radcą prawnym, adwokatem lub rzecznikiem patentowym naruszałoby prawnie chronioną tajemnicę zawodową, promotor będzie zwolniony z obowiązku raportowania. W takim przypadku powinien poinformować właściwy podmiot — co do zasady korzystającego albo promotora zlecającego mu czynności — o obowiązku przekazania informacji do Szefa KAS.

Zmiany te należy ocenić korzystnie jako istotne uproszczenie dla podatników, promotorów oraz doradców. Nie oznaczają one jednak całkowitego końca MDR.

Po wejściu w życie nowych przepisów nadal konieczna będzie analiza uzgodnień transgranicznych. Dotyczy to w szczególności transakcji z udziałem podmiotów zagranicznych, struktur holdingowych, płatności transgranicznych oraz reorganizacji obejmujących więcej niż jedną jurysdykcję.

W praktyce podatnicy powinni zweryfikować swoje procedury MDR, które dotychczas często obejmowały schematy krajowe, VAT i akcyzę. Po zmianach konieczne może być ich dostosowanie do nowego, węższego zakresu raportowania.

Szczególnej uwagi będą wymagały także przepisy przejściowe. W przypadku obowiązków MDR-1, których termin wykonania upływa 30 października 2026 r., zastosowanie znajdą jeszcze przepisy dotychczasowe. Jednocześnie po wejściu w życie ustawy nie będzie obowiązku składania MDR-3 dla schematów innych niż transgraniczne, nawet jeśli przed wejściem w życie nowelizacji złożono już MDR-1 dla takiego schematu.